간암은 조기 진단과 치료에 한계가 많아 환자의 생존율과 삶의 질을 저하시키는 주요 질병입니다. 본 기술은 이러한 문제 해결을 위해 활성화된 인핸서에서 발현되는 8종의 특정 eRNA(enhancer RNA)를 간암 진단용 바이오마커로 발굴했습니다. 간암 세포주 분석과 TCGA 데이터 검증을 통해 이 eRNA들이 정상 간 조직 대비 간암 조직에서 유의미하게 발현이 감소함을 확인했습니다. 이를 기반으로 eRNA 발현 수준을 측정하는 간암 진단용 조성물 및 키트를 제공하며, 이는 RT-PCR, DNA 칩 등 다양한 분석법으로 구현됩니다. 이 바이오마커들은 간암의 조기 발견을 돕고, 환자 맞춤형 치료 전략 수립에 기여하여 간암으로 인한 사회·경제적 부담을 줄이고 환자 예후를 향상시키는 데 크게 기여할 수 있습니다.

간암은 높은 사망률과 고액의 치료비용을 유발하며 기존 진단법으로는 조기 발견 및 예후 예측이 어렵습니다. 본 기술은 활성화된 인핸서에서 발현되는 특이적 eRNA인 TRAF3IP2-AS1을 간암 바이오마커로 활용합니다. 이 마커는 간암 환자에서 발현이 유의하게 증가하며 다른 암종에서는 특이성이 확인되었습니다. TRAF3IP2-AS1 eRNA 또는 이와 상관관계가 높은 mRNA 및 단백질 발현 수준을 RT-PCR, DNA 칩, ELISA 등 다양한 분석법으로 측정하여 간암을 진단합니다. 진단용 조성물 및 키트 형태로 제공됩니다. 이 기술을 통해 간암의 조기 진단 정확도를 높이고, 환자 분류 및 맞춤형 치료 계획 수립에 기여하여 간암으로 인한 사회경제적 부담을 줄일 수 있습니다.

현재 간암 진단 바이오마커는 예후 예측에 한계가 있으며 높은 치료 비용이 사회적 부담이 됩니다. 본 기술은 간암 환자에서 특이적으로 증가하는 SAP30L-AS1 eRNA를 새로운 진단 바이오마커로 제안합니다. 간암 세포주와 TCGA 데이터를 통한 연구에서 SAP30L-AS1 eRNA와 그 하위 타겟 유전자들의 발현 증가를 확인하여, 이를 활용한 진단 조성물, 키트 및 방법을 개발하였습니다. 이 바이오마커는 간암의 조기 진단, 환자 분류, 맞춤형 치료제 선택 및 치료 계획 수립에 우수한 효과를 제공하여 간암 환자의 삶의 질 향상에 크게 기여할 것입니다.

대장암 환자의 옥살리플라틴 약물 치료 시 환자별 반응성 예측이 어려워 비효율적인 치료가 발생했습니다. 본 기술은 환자 생체 시료에서 DNA 메틸화 수준을 측정하고 약물 반응성 스코어(DRS)를 계산하여 이러한 문제를 해결합니다. 특정 프로브를 이용해 DNA 메틸화 정도를 분석하고, 가중치 계수를 적용하여 DRS를 산출합니다. 이를 통해 옥살리플라틴 투약 전 환자에게 적합한 맞춤형 항암제를 선택하고 치료 계획을 수립하여 불필요한 비용 부담을 줄이고 환자 생존율을 높일 수 있습니다.

대장암 치료에 사용되는 5-FU 항암제의 약물 저항성으로 환자들이 불필요한 치료를 받거나 생존율이 저하되는 문제가 있습니다. 본 기술은 이러한 문제를 해결하기 위해 특정 CpG 프로브를 활용하여 대장암 환자의 5-FU 약물 반응성을 사전에 예측하는 조성물, 키트 및 방법을 제공합니다. 환자 유래 오가노이드 및 임상 데이터를 기반으로 DNA 메틸화 수준을 측정하고 약물 반응성 스코어(DRS)를 계산하여, 개개인의 5-FU 치료 적합성을 정확히 예측합니다. 이를 통해 투약 전 최적의 치료 계획을 수립하고 개인 맞춤형 항암 치료 전략을 제시하여 환자의 불필요한 고통과 비용 부담을 줄이며 궁극적으로 생존율을 향상시킬 수 있습니다.

기존 간암 진단 바이오마커의 한계와 제한적인 치료제 효과로 인해 정확한 진단과 효과적인 치료가 어려웠습니다. 본 기술은 간암에서 특이적으로 발현이 증가하는 신규 eRNA인 LINC01572를 바이오마커로 발굴하였습니다. LINC01572는 TCGA 데이터 분석 및 세포주 실험을 통해 간암에서 유의미하게 높은 발현을 보였으며, 이는 기존 바이오마커의 예측 부진 문제를 해결할 수 있습니다. LINC01572 발현 수준을 측정하는 진단 조성물 및 키트(RT-PCR, DNA 칩 등)를 제공하며, LINC01572 억제제(siRNA, shRNA, 안티센스 올리고뉴클레오티드)를 활용한 치료 방법을 제안합니다. 실제 실험에서 LINC01572 억제 시 간암 세포 성장이 25% 감소하는 효능을 확인했습니다. 이 기술은 간암의 조기 진단 정확도를 높이고 환자 맞춤형 치료 전략을 가능하게 하여, 간암 환자의 예후를 크게 개선할 것으로 기대됩니다.